搭乗の手続きには、チェックイン、手荷物の預け入れ、保安検査の３ステップがあります。A→B→Cと乗り継ぐ場合、通常はB空港での保安検査や手荷物預入手続きを省くため、A空港のカウンターに行き、A→BとB→Cのチェックインをした上で、手荷物を預け入れる場合はそれをC空港まで運ぶよう依頼します。そうすればB空港の着いたあと預入荷物はB→C便に移し替えられるので、お客様は搭乗待合室で次の便の出発を待って乗り継ぎます。

B空港で一旦荷物を受け取って外に出たい場合はそのことをA空港で預け入れる時に告げてください。この場合、B空港に着いたら搭乗待合室を出て預入荷物を受け取り、一旦外に出てからB→C便に乗るために手荷物の預入と保安検査をすることになります。

Q1の図で示した一発購入がお得です。24年11月末にQ1図のとおり購入したところ往復48020円で別々に買うより7400円お得でした。ただし、ANAタイムセールでは１便１万円以下で売ることがあるので、別々購入が安くなったりします。別々購入した場合、必ず出発空港のチェックインカウンターで乗継であることを告げて必要な手続きをしてください。

福島から大阪経由で那覇に飛ぶ場合で大阪１泊して乗り継ぐときは出発空港のチェックインカウンターで預け入れ荷物を大阪で降ろすよう告げてください。

A→B→Cと乗り継ぐ場合でBへの到着が遅れて乗り継げなかった場合、その後に出発するB→C便に空席待ちで搭乗いただくことになります。または、B→C便の航空賃の払戻しを440円の払戻手数料なしで受けることができます（ANA都合で遅れた場合も悪天候などで遅れた場合も）。

翌日に乗り継ぐ場合の宿泊費は、航空会社都合で遅れて乗り継げなかった場合（機材故障など）は航空会社負担（上限15000円ほど）、その他の場合（台風など）はお客様の負担になります（どちらもホテルはお客様で確保）。

ANA→JALの場合、出発空港のカウンターで乗継を告げて手続きをすれば預入荷物は乗継便に移し替えられます。JAL便のチェックインについては、大阪伊丹空港の場合、乗継用の通路を通ってJAL側に入り空席待ちカウンターでチェックインするか、オンラインで済ませて搭乗することになります。ANA/IBEX共同運航便をANAで購入した場合も同じです。これをIBEXで購入した場合は(便名がANA3179等でなくてIBX79等になっている場合は)、預入荷物をJALへ移し替えることができないので、乗継空港で一旦外に出て保安検査から入る必要があります（預入荷物がないなら通路からJAL側へ渡ってOK）。

A→B（伊丹）→Cと乗り継ぐ場合、伊丹空港では乗継必要時間が25分と定められています。ANA同士の乗継必要時間は伊丹25分、那覇30分、新千歳20分です。ANA⇔JALの乗継なら30分です。乗継時間がこれより短いと（たとえ両搭乗券を取得済みでも）預入荷物を受け取ってもらえません。チェックインはオンラインでできますので、預入荷物がなければ、乗継必要時間未満の乗継でも事実上可能です（自己責任で）。